據傳,媽祖昇天後,如果海風驟起,船舶遇難,只要口誦媽祖聖號,媽祖即會到場營救。不僅湄洲嶼民爭相傳頌,福建沿海一帶漁民,在海難中也企盼媽祖能前來相助,其在漁民心目中,儼然成為能保護他們的海洋之神。
基隆玉勅奉天宮所奉祀之媽祖一般稱為「港口媽」,由宜蘭縣蘇澳鎮北方澳進安宮直屬分靈來的,一般稱北方澳媽。又因本宮聖母是在廟的港口得以分別基隆玉勅奉天宮所以又稱港口媽。信仰區域涵蓋基隆台北縣泰山鄉.宜蘭縣南方澳,後建廟奉祀,現已成為地方信仰中心。
現存於正殿的媽祖神像共有鎮殿媽、開基大媽
開基二媽、開基三媽、開基四媽、開基五媽、開基六媽、開基爐主媽、開基副爐主媽、鹿港媽、新港媽、北港媽及港口媽等,各尊神像之稱法不同,主要是為了方便信徒恭迎膜拜,另有在名稱之前冠上以「基隆玉勅奉天宮港口媽,則是為區別該尊神像分靈之地。
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